La fonction d’une protéine est conférée par sa structure tridimensionnelle. La connaissance de cette structure est essentielle pour comprendre le fonctionnement de la protéine et pour permettre son ciblage par des médicaments.

Prédire quelles sont les structures stables parmi toutes les structures possibles est considéré à l’heure actuelle comme un des plus grands problèmes de la biologie moderne et les méthodes actuelles sont extrêmement coûteuses en temps et en argent malgré l’outil informatique.

Pour tenter de faire face à ce défi, David Baker, professeur de biochimie à l’Université de Washington, vient de lancer Fold It, un jeu dont le but est de prédire la structure de protéines en faisant appel à l’intuition des joueurs. Les protéines sont présentées sous forme de puzzle que le joueur est chargé de plier manuellement. Les résultats sont envoyés au laboratoire de Baker pour être analysés. Un classement est établi pour classer les joueurs en fonction de la qualité des repliements effectués.

D’ici quelques mois, de nouvelles fonctionnalités seront ajoutées au jeu pour permettre aux utilisateurs de concevoir des protéines totalement nouvelles qui pourraient permettre de prévenir ou de guérir des maladies importantes.

>> le site officiel du projet: http://fold.it/portal
>> Quelques explications en français
>> toutes les vidéos du projet sur YouTube

Le café pédagogique présente ce mois-ci un dossier réalisé par François Jarraud intitulé : Enseigner avec le jeu ?

“Le jeu peut-il être un bon auxiliaire pour l’enseignement ? C’est le dossier de ce numéro. A l’origine de ce dossier, la publication de la thèse de Julian Alvarez sur le jeu sérieux. Il montre précisément à quelles conditions pédagogiques le jeu vidéo peut devenir un outil d’enseignement. Nous avons croisé ce regard avec celui du sociologue Laurent Trémel qui analyse pour nous le phénomène. Pourquoi cette efficacité du jeu ? Le cognitiviste Idriss Aberkane nous explique quels mécanismes cérébraux sont mobilisés par le jeu. Et si le jeu nous permettait de mieux comprendre l’enseignement ? Retrouvez ensuite le dossier décliné dans les disciplines.”

• Le jeu sérieux : un nouvel horizon pour l’Ecole ? Entretien avec Julian Alvarez
• “Notre cerveau est conçu pour l’action”. Entretien Idriss Aberkane
• Pour le sociologue Laurent Trémel: faire preuve de circonspection
• Dans les disciplines, le jeu

Voici un article très intéressant écrit par Hovig Ter Minassian et Samuel Rufat publié sur Cybergeo (revue européenne de géographie) dans lequel les auteurs s’interrogent sur les apports et limites du jeu vidéo “commercial” pour le géographe.

Résumé/Abstract: Après les jeux de société, les jeux vidéo sont adaptés, utilisés pour l’enseignement et la formation continue. L’analyse de deux séries de jeux, Sim City et Civilization, montre que les jeux vidéo disponibles dans le commerce ont un triple intérêt pour le géographe, en tant qu’objets géographiques, outils pédagogiques et de modélisation. Mais si les jeux vidéo se présentent comme de puissants outils, les représentations des concepteurs et des joueurs qu’ils véhiculent poussent à s’interroger sur leurs limites. Les jeux vidéo apparaissent alors à la fois comme un nouveau champ de recherche qui reste à explorer et l’occasion pour les géographes de réfléchir sur la manière d’améliorer un outil attractif et puissant.

Référence: Hovig Ter Minassian et Samuel Rufat, « Et si les jeux vidéo servaient à comprendre la géographie ? », Cybergeo, Science et Toile, article 418, mis en ligne le 27 mars 2008, modifié le 16 avril 2008. URL : http://www.cybergeo.eu/index17502.html. Consulté le 08 mai 2008.

>> lire l’article: http://www.cybergeo.eu/index17502.html